甘家湖梭梭林國家級自然保護區屬于盆地地帶，地處歐亞大陸橋的腹地，實際上是低洼地中的一片沙海，遠離海洋，該保護區在大的地貌單元上屬于以艾比湖為中心凹陷的平緩起伏的荒漠平原，其地貌類型大致有山前傾斜礫質洪積平原，中部土質沖擊平原，風積沙丘地貌類型和現代河流沖擊地貌類型四種類型。

 保護區既受溫帶天氣系統或北冰洋冷空氣所制約，又受南亞干旱氣流的影響，因而光熱資源豐富，無霜期較長，風多而大，夏季炎熱，冬季嚴寒，氣溫日、年溫差大，干燥少雨，蒸發強烈，具有溫帶大陸性干旱氣候的特征，太陽總輻射量約為128千卡/平方厘米，年日照時數為2700小時/年，大于10℃，年平均氣溫6.7℃，無霜期180天左右，年降水量140毫米，年蒸發量達到2000毫米，年平均風速1.4米/秒，最大風速23米/秒，主風向為西南風。

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